Varaxsha qadimiy aholi punktining bir qismi boʻlib, uning hududida arablar istilosidan oldin Buxoro vohasini boshqargan buxorxudotlar qarorgohi boʻlgan. XI-asrda Varaxshada hayot toʻxtab qoladi. Varaxshaning tanazzulga uchrashiga vohaning sugʻorish tizimlarida suv yetishmasligi sabab boʻlgan.
